Mestské múzeum v Pezinku sa nachádza v priestoroch renesančnej radnice na ulici M. R. Štefánika 1 v Pezinku. Zriaďovateľom múzea je mesto Pezinok. Slávnostné otvorenie múzea sa konalo 18. septembra 2003. Základ stálej expozície múzea tvoria predmety, získané z archeologických výskumov, ktoré múzeum realizovalo alebo spolurealizovalo od svojho založenia. Expozícia je rozdelená na tri časti podľa historického obdobia a miesta výskumu.

Súčasťou Mestského múzea v Pezinku je aj Galéria Jána Kupeckého, ktorá poskytuje priestor umelcom z Pezinka a blízkeho okolia. Galéria je pomenovaná po významnom slovenskom maliarovi Jánovi Kupeckom, ktorý sa narodil v Pezinku v roku 1892.